Punk in Africa avslöjar den oberättade historien om den mångkulturella punkrörelsen som växte fram mitt i den senaste tidens politiska och sociala omvälvning i tre sydafrikanska länder: Sydafrika, Moçambique och Zimbabwe. I dessa samhällen förkroppsligade punk-subkulturen en radikal politisk ståndpunkt och blomstrade mot en bakgrund av ekonomiska svårigheter, inbördeskrig och kampen mot apartheid. Filmen spårar rörelsens utveckling från dess rötter i Johannesburgs underground-rockscen i början av 70-talet, via födelsen av de första mångkulturella punkbanden efter Soweto-upproret och 80-talets militanta anti-apartheid hardcore-akter, till den firande, afrikanskt inspirerade ska-punken under det demokratiska 90-talet som spreds från Kapstaden till Maputo. Dokumentären visar hur en ny generation bygger vidare på detta arv för att konfrontera samtida politiska utmaningar i Zimbabwe och frågor om afrikaaner-identitet i Sydafrika, samtidigt som punkandan fortsätter att spridas över kontinenten.